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Incluir las técnicas de transcriptómica espacial y de secuenciación de célula única permitirá analizar interacciones de las células tumorales entre sí, o con otras células normales para explicar respuestas a los tratamientos Este avance ha sido posible gracias a la financiación de la Agencia Estatal de Investigación y la Universidad de Salamanca. El Centro de Investigación del Cáncer abrirá estos servicios a toda la comunidad científica, hospitales y empresas biotecnológicas.
El estudio del cáncer ha entrado en una nueva dimensión en Castilla y León. El Centro de Investigación del Cáncer, un centro mixto de investigación del CSIC, la Universidad de Salamanca y la Fundación para la Investigación del Cáncer de la Universidad de Salamanca, ha dado un salto cualitativo en su capacidad de análisis con la puesta en marcha de dos servicios tecnológicos de última generación: la secuenciación de célula única (single cell) y la transcriptómica espacial.
Gracias a la transcriptómica espacial, los investigadores disponen de un “GPS molecular” para cartografiar de forma exacta esta complejidad de los tumores en dos dimensiones sin destruir la estructura original de la muestra o de la biopsia que se analiza. “Al mantener la estructura del tejido analizado, podemos identificar interacciones de las células tumorales entre sí, o con otras células normales, que antes eran invisibles y que pueden explicar, por ejemplo, por qué unos pacientes responden al tratamiento y otros sufren recaídas", señala la Dra. Sandra Blanco, la coordinadora científica de la Unidad de Genómica del Centro de Investigación del Cáncer de Salamanca.
Por su parte, la secuenciación de célula única permite leer el “manual de instrucciones” individual de cada una de los miles de células que componen un tumor, identificando alteraciones genéticas raras que suelen pasar desapercibidas en los análisis convencionales. Al poder ser aisladas de todas las zonas del tumor, esta técnica permite saber con una precisión nunca alcanzada hasta ahora cada tipo y subtipo celular que forma parte de la masa tumoral analizada.
“La versatilidad de estas dos tecnologías es enorme, dado que permiten el análisis de las células tumorales a diferentes niveles: expresión génica, caracterización de alteraciones genéticas principales e, incluso, expresión de proteínas”, señala la Dra. Encarna Fermiñán, responsable técnica de estos dos servicios.
Hasta ahora, la mayoría de los análisis genéticos se realizaban de forma masiva, triturando una muestra de tejido y, tras el análisis genómico o proteómico, se obtenía una "media" de la expresión génica de todas las células. El problema es que el cáncer no es uniforme. Se trata de un ecosistema heterogéneo donde unas pocas células pueden ser las responsables de la iniciación del tumor, de la resistencia a los tratamientos o de viajar a otros órganos para causar metástasis. Además, las células tumorales pueden cambiar su patrón de expresión génica dependiendo de la zona del tumor donde se albergan y es importante identificar cuáles son las células normales que están en su entorno. Esta variabilidad “geográfica” puede condicionar las propiedades malignas de las células tumorales, su capacidad de responder a fármacos o su habilidad para evadir el sistema inmune.
“El cáncer ya no se estudia globalmente como una masa aislada y uniforme, sino como un mosaico complejo en donde cada célula que lo compone sea esta tumoral o normal, puede cambiar en función de su entorno”, explica la Dra. Blanco.
La adquisición de estos equipos de vanguardia sitúa a Salamanca en la primera línea de la investigación oncológica de nuestro país. Esta actualización estratégica ha sido posible gracias a la financiación obtenida procedente del Programa de Adquisición de Infraestructuras Científicas de la Agencia Estatal de Investigación y a la cofinanciación realizada por parte de la Universidad de Salamanca. Los equipos ya están disponibles en la Unidad de Genómica del Centro de Investigación del Cáncer de Salamanca que, este año, cumple 25 años de actividad.
El director del Centro de Investigación del Cáncer, el Dr. Xosé Bustelo, destaca que “esta infraestructura no solo potencia el trabajo de nuestros investigadores, sino que está abierta a toda la comunidad científica nacional. Queremos que cualquier grupo académico, hospital o empresa biotecnológica pueda acceder a estas herramientas de frontera para acelerar sus descubrimientos”.
Por su parte, José Miguel Mateos Roco, vicerrector de Investigación de la USAL, subraya que la participación de la Universidad de Salamanca en el Centro de Investigación del Cáncer es “una muestra del compromiso que tiene como institución impulsora del desarrollo del conocimiento, que, además, en este caso constituye la principal expresión de su vocación de servicio a la sociedad, a través de algo tan importante como es el estudio del cáncer con objeto de mejorar su prevención y su tratamiento”.
Para mostrar el potencial práctico de estas tecnologías, el Centro de Investigación del Cáncer celebrará el próximo 24 de febrero, a las 10:30 horas en su Salón de Actos, una jornada técnica sobre las nuevas plataformas de análisis de genómica de alta resolución. El evento contará con la participación de investigadores e investigadoras de referencia como los Dres. Alberto M. Pendás, Javier de las Rivas, Maribel Fernández Pisonero y Miguel Alcoceba, quienes mostrarán ejemplos prácticos de cómo estas técnicas se están aplicando ya para descifrar cuestiones de alto interés básico y clínico en el área de cáncer. El seminario es gratuito y de acceso libre,
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